More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4004 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  92.58 
 
 
256 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  74.22 
 
 
256 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  59.61 
 
 
259 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  50 
 
 
256 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.47 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  44.4 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  43.57 
 
 
242 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.87 
 
 
239 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  46.81 
 
 
242 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  46.38 
 
 
242 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.96 
 
 
242 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  45.11 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
264 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  42.02 
 
 
262 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
267 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 
255 aa  168  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  42.29 
 
 
276 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  40.69 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  45.96 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  41.6 
 
 
469 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
394 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  36.93 
 
 
245 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  37.82 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 
467 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  39.51 
 
 
478 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  38.06 
 
 
267 aa  148  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.8 
 
 
417 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  40.76 
 
 
425 aa  145  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.68 
 
 
482 aa  144  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.51 
 
 
237 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  40.8 
 
 
426 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
422 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.74 
 
 
239 aa  141  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.07 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.34 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  38.02 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  40.52 
 
 
234 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 
247 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.08 
 
 
238 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  41.87 
 
 
507 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.86 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  42.17 
 
 
395 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.8 
 
 
247 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  32.49 
 
 
241 aa  138  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  33.62 
 
 
239 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
477 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  42.86 
 
 
248 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  34 
 
 
419 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  39.83 
 
 
441 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  43.52 
 
 
216 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  39.57 
 
 
239 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 
472 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.84 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.78 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  40.87 
 
 
466 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  33.19 
 
 
239 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  35.44 
 
 
325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  37.5 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.5 
 
 
236 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  41.13 
 
 
252 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 
449 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  38.08 
 
 
519 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  34.18 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  41.45 
 
 
463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  38.4 
 
 
452 aa  133  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  39.66 
 
 
505 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  39.38 
 
 
500 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
361 aa  131  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  38.86 
 
 
463 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.99 
 
 
540 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
462 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  39.91 
 
 
404 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 
323 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  31.37 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  35.55 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  37.94 
 
 
313 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  33.2 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  39.41 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  38.18 
 
 
514 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  37.89 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  36.96 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  33.89 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  33.89 
 
 
250 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  39.02 
 
 
305 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  38.1 
 
 
265 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.53 
 
 
421 aa  125  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  37.77 
 
 
416 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  37.67 
 
 
364 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.75 
 
 
280 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  37.83 
 
 
241 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  37.04 
 
 
474 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  37.22 
 
 
478 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
597 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 
250 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.66 
 
 
241 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.45 
 
 
611 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>