More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1743 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
241 aa  483  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  90.46 
 
 
241 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  56.49 
 
 
463 aa  267  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  54.39 
 
 
505 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.59 
 
 
482 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  53.16 
 
 
478 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  55.19 
 
 
472 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  55.22 
 
 
478 aa  239  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  54.01 
 
 
477 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  51.46 
 
 
519 aa  234  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  50.42 
 
 
540 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  53.07 
 
 
491 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.07 
 
 
491 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.07 
 
 
491 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  53.51 
 
 
514 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  51.75 
 
 
474 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  51.25 
 
 
239 aa  228  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  51.87 
 
 
449 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.51 
 
 
516 aa  228  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.46 
 
 
239 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  52.08 
 
 
507 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  52.63 
 
 
517 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  49.38 
 
 
466 aa  225  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  54.17 
 
 
421 aa  224  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  51.67 
 
 
474 aa  224  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  50.83 
 
 
426 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  48.96 
 
 
463 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  51.26 
 
 
469 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  49.17 
 
 
441 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  51.03 
 
 
479 aa  208  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  49.57 
 
 
467 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  48.76 
 
 
500 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  49.36 
 
 
462 aa  201  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  47.54 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  49.58 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  46.44 
 
 
247 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  49.15 
 
 
511 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  47.19 
 
 
364 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  44.81 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  43.39 
 
 
554 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  43.85 
 
 
564 aa  181  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  44.07 
 
 
395 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  44.62 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  42.32 
 
 
567 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  45.02 
 
 
519 aa  178  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  44.86 
 
 
571 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  42.44 
 
 
558 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.62 
 
 
438 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  43.16 
 
 
425 aa  165  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  48.22 
 
 
687 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  42.55 
 
 
404 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.06 
 
 
452 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  42.36 
 
 
236 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
394 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  42.49 
 
 
239 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.33 
 
 
237 aa  148  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  45.23 
 
 
369 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  44.64 
 
 
416 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  42.61 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.89 
 
 
238 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  39.58 
 
 
241 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  36.48 
 
 
236 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  40.08 
 
 
258 aa  142  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
244 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  41.88 
 
 
422 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  40.65 
 
 
361 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  42.67 
 
 
319 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  41.88 
 
 
381 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  43.51 
 
 
355 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.24 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  41.13 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  35.25 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  34.43 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.47 
 
 
247 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1982  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.17 
 
 
268 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  39.58 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.04 
 
 
276 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  39.17 
 
 
242 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.92 
 
 
243 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  37.93 
 
 
538 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  35.25 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  37.05 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  43.75 
 
 
348 aa  131  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  34.84 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.59 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  32.64 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  38.71 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1382  protein serine/threonine phosphatase  38.27 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.344903  hitchhiker  0.00931102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  36.55 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  34.84 
 
 
250 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
252 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
249 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  38.36 
 
 
323 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.54 
 
 
597 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>