More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6203 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  54.39 
 
 
247 aa  248  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  55.08 
 
 
426 aa  244  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  54.24 
 
 
441 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  52.32 
 
 
265 aa  224  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  49.79 
 
 
540 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  52.32 
 
 
253 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  51.23 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  50.21 
 
 
421 aa  205  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  52.81 
 
 
467 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  48.52 
 
 
449 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  50.42 
 
 
472 aa  198  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  50.21 
 
 
519 aa  197  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  47.66 
 
 
505 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  48.1 
 
 
466 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  47.86 
 
 
478 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.44 
 
 
482 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  48.54 
 
 
477 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  46.22 
 
 
474 aa  191  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  50 
 
 
469 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  45.57 
 
 
463 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  46.81 
 
 
507 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.46 
 
 
516 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  47.46 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  53.09 
 
 
491 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.09 
 
 
491 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50.22 
 
 
517 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.09 
 
 
491 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  48.55 
 
 
463 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  53.09 
 
 
514 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  47.83 
 
 
474 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  44.54 
 
 
500 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  48.32 
 
 
479 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  45.38 
 
 
425 aa  172  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  47.42 
 
 
478 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  41.28 
 
 
571 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  45.49 
 
 
462 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  44.92 
 
 
355 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  46.09 
 
 
452 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  44.26 
 
 
369 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  43.23 
 
 
395 aa  165  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.77 
 
 
438 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
238 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  42.86 
 
 
241 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.49 
 
 
241 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  44.44 
 
 
239 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  42.31 
 
 
394 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  44.2 
 
 
416 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  43.17 
 
 
364 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.12 
 
 
239 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.25 
 
 
237 aa  154  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  40.08 
 
 
558 aa  154  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  40.17 
 
 
567 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  43.53 
 
 
422 aa  151  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  40.81 
 
 
687 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  42.86 
 
 
511 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  43.1 
 
 
404 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  37.15 
 
 
258 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.39 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
597 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  36.9 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  39.91 
 
 
320 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  42.62 
 
 
325 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  41.95 
 
 
323 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.29 
 
 
611 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
361 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  40.59 
 
 
519 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.25 
 
 
238 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  34.03 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  41.63 
 
 
386 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
319 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.78 
 
 
280 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
244 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  37.75 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  41.44 
 
 
293 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  38.02 
 
 
267 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.73 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  39.5 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  35.71 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  37.34 
 
 
564 aa  135  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  41.13 
 
 
236 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  38.49 
 
 
293 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
435 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  34.94 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  35.27 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  34.94 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.85 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
247 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
254 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  35.71 
 
 
245 aa  133  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.33 
 
 
554 aa  132  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  38.11 
 
 
417 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
256 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
256 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
256 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  39.66 
 
 
242 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  38.19 
 
 
269 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.54 
 
 
245 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>