More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0026 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
438 aa  868    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  39.39 
 
 
474 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.23 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  38.85 
 
 
441 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.62 
 
 
449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  41.72 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.28 
 
 
421 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  33.4 
 
 
554 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  40.14 
 
 
463 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.6 
 
 
564 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.62 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  37.14 
 
 
478 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.28 
 
 
466 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  39.37 
 
 
479 aa  223  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
519 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  37.27 
 
 
469 aa  216  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  50.19 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  41.24 
 
 
477 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  45.25 
 
 
540 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  45.35 
 
 
463 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  46.92 
 
 
253 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  46.96 
 
 
478 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  36.72 
 
 
505 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  43.94 
 
 
265 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  40.05 
 
 
491 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.05 
 
 
491 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.05 
 
 
491 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  36.63 
 
 
514 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  46.22 
 
 
507 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  48.23 
 
 
474 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  45.15 
 
 
247 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  29.93 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  43.97 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50 
 
 
517 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.46 
 
 
516 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  44.86 
 
 
241 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  31.91 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  40.61 
 
 
259 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  45.3 
 
 
511 aa  170  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  41 
 
 
571 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.62 
 
 
241 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  47.03 
 
 
687 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  42.28 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  40.64 
 
 
567 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  41.7 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.32 
 
 
239 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  41.32 
 
 
239 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  41.67 
 
 
519 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  41.1 
 
 
558 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  41.06 
 
 
364 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
395 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  34.76 
 
 
422 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  42.74 
 
 
369 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  36.78 
 
 
245 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  40.66 
 
 
361 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 
239 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.47 
 
 
247 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.49 
 
 
237 aa  147  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1982  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.17 
 
 
268 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  39.06 
 
 
256 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  38.22 
 
 
597 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 
313 aa  143  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  41.41 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
238 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 
239 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 
256 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.5 
 
 
319 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  34.32 
 
 
236 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.96 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.56 
 
 
238 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.45 
 
 
611 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  32.07 
 
 
236 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  39.66 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2540  protein serine/threonine phosphatases  40.97 
 
 
245 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  34.84 
 
 
250 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 
254 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.12 
 
 
241 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  34.44 
 
 
241 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  32.14 
 
 
258 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  33.33 
 
 
250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  34.43 
 
 
250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 
538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  36.29 
 
 
305 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  36.64 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 
257 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1283  protein serine/threonine phosphatase  37.16 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.646496  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  33.88 
 
 
250 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  38.96 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  34.25 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
355 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  35.17 
 
 
245 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 
241 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 
262 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
244 aa  126  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.02 
 
 
261 aa  126  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>