More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0034 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  67.36 
 
 		 564 aa  690    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  100 
 
 		 554 aa  1144    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  39.22 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  52.52 
 
 		 507 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  33.72 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  46.1 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  50.76 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  33.4 
 
 		 567 aa  230  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  51.28 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  32.57 
 
 		 474 aa  220  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  45.7 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  31.72 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  39.94 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.83 
 
 		 438 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  44.15 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  44.12 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  42.86 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  41.47 
 
 		 540 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.39 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  40.55 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  40.91 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  42.5 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  42.42 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  41.84 
 
 		 247 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  32.85 
 
 		 519 aa  191  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  41.6 
 
 		 478 aa  190  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 		 519 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  43.42 
 
 		 514 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  41.18 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.39 
 
 		 241 aa  183  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  40.98 
 
 		 265 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.24 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  43.91 
 
 		 452 aa  182  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  43.09 
 
 		 239 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  38.24 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.24 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.85 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  41.25 
 
 		 241 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  42.24 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.11 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  40.68 
 
 		 469 aa  176  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  41.63 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  40.53 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.15 
 
 		 239 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  40.87 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  40.91 
 
 		 253 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  40.41 
 
 		 404 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  42.19 
 
 		 394 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.51 
 
 		 247 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  43.16 
 
 		 364 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 		 259 aa  157  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  38.21 
 
 		 255 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  37.19 
 
 		 250 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.86 
 
 		 237 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.08 
 
 		 280 aa  153  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 		 238 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 		 687 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.87 
 
 		 320 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 538 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.96 
 
 		 236 aa  144  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  37.45 
 
 		 274 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.79 
 
 		 247 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  36.21 
 
 		 264 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  33.47 
 
 		 250 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 		 270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 		 422 aa  140  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  37.02 
 
 		 243 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  35.74 
 
 		 325 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  36.82 
 
 		 276 aa  140  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  34.43 
 
 		 254 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.99 
 
 		 597 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.03 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 		 241 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 		 249 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.25 
 
 		 257 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  37.66 
 
 		 369 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  35.47 
 
 		 246 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 		 313 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 		 252 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  36.64 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  31.36 
 
 		 574 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.01 
 
 		 245 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  33.1 
 
 		 361 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 		 259 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  37.59 
 
 		 285 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 		 259 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 258 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 		 241 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35 
 
 		 238 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  32.77 
 
 		 247 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  32.77 
 
 		 247 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  33.47 
 
 		 250 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 		 250 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  33.06 
 
 		 250 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  36.93 
 
 		 381 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  35.92 
 
 		 261 aa  134  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.82 
 
 		 258 aa  134  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3469  protein serine/threonine phosphatase  37.18 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171174  normal  0.272032 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  36.51 
 
 		 348 aa  133  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>