More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1283 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1283  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
482 aa  988    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.646496  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  41.33 
 
 
455 aa  246  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
538 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  37.05 
 
 
266 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.24 
 
 
236 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.16 
 
 
438 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  33.01 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  36.89 
 
 
245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  35.69 
 
 
256 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.94 
 
 
257 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 
259 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 
259 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  35.34 
 
 
258 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  36.89 
 
 
245 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.55 
 
 
441 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  32.5 
 
 
571 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 
256 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  34.19 
 
 
269 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 
256 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 
256 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  35.27 
 
 
238 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.08 
 
 
507 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
252 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  38.17 
 
 
452 aa  124  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 
247 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.66 
 
 
466 aa  123  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
416 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  34.03 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  33.21 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
239 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  36.63 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.47 
 
 
245 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.21 
 
 
426 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  36.03 
 
 
240 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.3 
 
 
237 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
404 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 
395 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.43 
 
 
241 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  32.92 
 
 
243 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  34.29 
 
 
261 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  31.12 
 
 
236 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  32.81 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  37.65 
 
 
389 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  35.1 
 
 
449 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  33.61 
 
 
425 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  28.45 
 
 
505 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  32.69 
 
 
267 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 
254 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 
241 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
244 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  35.37 
 
 
265 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  33.79 
 
 
472 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.35 
 
 
247 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  34.71 
 
 
540 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  32.41 
 
 
250 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  30.41 
 
 
474 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  37.3 
 
 
348 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  35.86 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  31.41 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 
500 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  31.97 
 
 
246 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  32.52 
 
 
264 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  33.08 
 
 
276 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
270 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  31.23 
 
 
250 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 
597 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  31.23 
 
 
250 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 
234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  33.08 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  32.7 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  37.25 
 
 
234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  32.41 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  34.44 
 
 
293 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 
271 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  32.41 
 
 
250 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  32.41 
 
 
250 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  32.41 
 
 
250 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  32.41 
 
 
250 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  33.06 
 
 
250 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  33.33 
 
 
445 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 
239 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  33.71 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  31.62 
 
 
250 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
733 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  30.5 
 
 
558 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.03 
 
 
271 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  31.23 
 
 
250 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 
250 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  35.89 
 
 
252 aa  110  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
241 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  32.02 
 
 
293 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  32.17 
 
 
574 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  33.61 
 
 
239 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  34.54 
 
 
519 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.89 
 
 
238 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.47 
 
 
241 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.77 
 
 
239 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>