More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3183 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  55 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  44.54 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  45.22 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  43.86 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.8 
 
 		 452 aa  162  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  38.52 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  37.66 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  40.17 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  38.89 
 
 		 425 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  35.69 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  34.92 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  39.08 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  39.25 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  43.78 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.53 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  42.23 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  39.84 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  40.09 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.9 
 
 		 540 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  40.25 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.66 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  32.82 
 
 		 554 aa  139  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.34 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  38.83 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.19 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.4 
 
 		 507 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  35.85 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  33.33 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  35.96 
 
 		 574 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.53 
 
 		 243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  34.87 
 
 		 548 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  36.67 
 
 		 441 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 		 567 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  35.08 
 
 		 571 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  38.7 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 		 259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  39.32 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  41.35 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  37.5 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  37.5 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  35.12 
 
 		 558 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  38.79 
 
 		 239 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  41.92 
 
 		 364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  38.02 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  36.61 
 
 		 474 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 		 416 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  34.41 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.48 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  37.08 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.62 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.92 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  38.1 
 
 		 463 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  38.06 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  36.8 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  37.82 
 
 		 538 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.84 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  38.39 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  37.75 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1295  protein serine/threonine phosphatase  39.65 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  36.25 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  35.17 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  35.25 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  34.17 
 
 		 244 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 		 463 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  34.19 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1360  protein phosphatase  39.21 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  32.68 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.6 
 
 		 438 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  32.12 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.72 
 
 		 419 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.06 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  32.64 
 
 		 564 aa  125  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.72 
 
 		 422 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  38.46 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  31.88 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  37.19 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  32.81 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  38.82 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  35.06 
 
 		 505 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.26 
 
 		 611 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  34.48 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  31.44 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.78 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.6 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  34.32 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  31.75 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  36.55 
 
 		 477 aa  122  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>