More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1928 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  60.41 
 
 
274 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  46.91 
 
 
323 aa  215  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  46.37 
 
 
325 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  49.37 
 
 
285 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  46.15 
 
 
293 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  46.52 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  43.75 
 
 
284 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  44.1 
 
 
296 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  45.42 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  45.66 
 
 
256 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.87 
 
 
280 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  39.26 
 
 
554 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  41.6 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 
395 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  41.63 
 
 
452 aa  162  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  41.45 
 
 
267 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40.94 
 
 
394 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  43.72 
 
 
302 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
238 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  40.33 
 
 
425 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  42.8 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  37.13 
 
 
564 aa  152  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  42.15 
 
 
256 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  40.95 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  38.34 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  39.51 
 
 
558 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.45 
 
 
237 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.85 
 
 
238 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.2 
 
 
404 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 
567 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.6 
 
 
507 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  35.92 
 
 
247 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  40.85 
 
 
276 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
255 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  37.76 
 
 
571 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  34.71 
 
 
500 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.08 
 
 
438 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
319 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  37.24 
 
 
421 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  38.62 
 
 
478 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
467 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.06 
 
 
247 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  39.51 
 
 
479 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.17 
 
 
274 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  37.35 
 
 
245 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  34.41 
 
 
463 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  37.8 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  38.11 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.54 
 
 
258 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  34.17 
 
 
239 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 
364 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 
245 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
472 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  36.29 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 
463 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.27 
 
 
482 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 
422 aa  132  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.17 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 
449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  34 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  35.2 
 
 
540 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  37.08 
 
 
505 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  36.05 
 
 
276 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.53 
 
 
271 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  37.24 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.37 
 
 
466 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
236 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  37.92 
 
 
469 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  34.66 
 
 
241 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.86 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  40.52 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.91 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  32.11 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  37.4 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1685  protein serine/threonine phosphatase  41.67 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 
477 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  36.84 
 
 
474 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  36.93 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  38.02 
 
 
234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
416 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  35.57 
 
 
266 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  30.89 
 
 
250 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  31.2 
 
 
474 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  33.46 
 
 
261 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  33.73 
 
 
548 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  33.75 
 
 
243 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  33.06 
 
 
250 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.71 
 
 
597 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.48 
 
 
519 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  36.59 
 
 
246 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>