More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1685 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1685  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
221 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  39.51 
 
 
325 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 
296 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  42.92 
 
 
250 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  40.16 
 
 
323 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.38 
 
 
395 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  40.43 
 
 
425 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  43.97 
 
 
452 aa  143  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 
287 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  40.96 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  43.17 
 
 
266 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  41.53 
 
 
258 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  41.03 
 
 
285 aa  135  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  35.83 
 
 
564 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  36.51 
 
 
247 aa  131  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  36.93 
 
 
554 aa  131  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  37.5 
 
 
466 aa  131  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  40.69 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  38.53 
 
 
540 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  38.3 
 
 
394 aa  129  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  37.93 
 
 
505 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.31 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  38.72 
 
 
259 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  37.55 
 
 
293 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.1 
 
 
421 aa  124  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
449 aa  124  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  35.93 
 
 
426 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.76 
 
 
438 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
422 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  39.26 
 
 
274 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  33.88 
 
 
245 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.2 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  39.11 
 
 
305 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  38.3 
 
 
571 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  39.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  37.84 
 
 
396 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  42.48 
 
 
302 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.83 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0530  serine/threonine protein phosphatase, putative  36.97 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  40.51 
 
 
270 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.47 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  36.05 
 
 
441 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.97 
 
 
417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  33.47 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  34.26 
 
 
261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  35.39 
 
 
463 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  39.48 
 
 
479 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
477 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.3 
 
 
241 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  38.49 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.89 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
519 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  35.83 
 
 
469 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.02 
 
 
320 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  40.53 
 
 
404 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.89 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  36.17 
 
 
474 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  36.48 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 
500 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  35.12 
 
 
538 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.01 
 
 
517 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.56 
 
 
516 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  31.02 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 
241 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  37.1 
 
 
491 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  36.32 
 
 
472 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 
236 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.1 
 
 
491 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.1 
 
 
491 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  35.52 
 
 
419 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
519 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.72 
 
 
247 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  33.63 
 
 
478 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  34.82 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  36.91 
 
 
271 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.93 
 
 
507 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  29.69 
 
 
273 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  35.98 
 
 
558 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 
241 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  36.91 
 
 
595 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  38.39 
 
 
514 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  32.47 
 
 
264 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  38.27 
 
 
348 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  34.87 
 
 
443 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  37.24 
 
 
253 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
256 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  34.32 
 
 
259 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  35.46 
 
 
296 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
319 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 
567 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>