More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  57.59 
 
 
296 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  52.48 
 
 
287 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  48.45 
 
 
323 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  47.39 
 
 
325 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  47.31 
 
 
284 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  51.82 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  51.72 
 
 
258 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.3 
 
 
280 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  47.03 
 
 
285 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  50 
 
 
266 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  44.49 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  43.98 
 
 
270 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  40.08 
 
 
425 aa  165  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  46.75 
 
 
256 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.6 
 
 
395 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  41.06 
 
 
452 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.8 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  38.33 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
241 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.01 
 
 
597 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.77 
 
 
422 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.31 
 
 
238 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.8 
 
 
611 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.98 
 
 
237 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.09 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  40.68 
 
 
252 aa  133  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1685  protein serine/threonine phosphatase  42.48 
 
 
221 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  39.18 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  34.05 
 
 
449 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.05 
 
 
238 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
364 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  37.08 
 
 
259 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  32.33 
 
 
239 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  32.19 
 
 
239 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  35.59 
 
 
463 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.17 
 
 
564 aa  126  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  36.45 
 
 
519 aa  125  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  34.03 
 
 
247 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.32 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
253 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  36.14 
 
 
246 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
256 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  31.17 
 
 
554 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  34.33 
 
 
239 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.42 
 
 
247 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  35.34 
 
 
243 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 
404 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  35.5 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  36.18 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  35.56 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  33.97 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  36.44 
 
 
507 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.96 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  37.77 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.55 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  31.09 
 
 
250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  32.85 
 
 
574 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
293 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 
463 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  35.56 
 
 
242 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  34.17 
 
 
538 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.39 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.69 
 
 
245 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.17 
 
 
381 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  28.57 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  34.22 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  34.47 
 
 
571 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  34.05 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 
244 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.57 
 
 
242 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 
500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  32.5 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.69 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  36.77 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  36.55 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  35.47 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  37.82 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  27.62 
 
 
241 aa  113  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.04 
 
 
271 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  37.24 
 
 
519 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  36.6 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  35.37 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  31.03 
 
 
548 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  36.22 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  35.55 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  34.75 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
256 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  33.47 
 
 
242 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
256 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>