More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0456 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  51.06 
 
 
296 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  44.04 
 
 
284 aa  218  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  47.92 
 
 
323 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  43.51 
 
 
325 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  42.91 
 
 
258 aa  208  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  52.38 
 
 
302 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  45.83 
 
 
285 aa  188  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  46.35 
 
 
293 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  43.59 
 
 
266 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.8 
 
 
280 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  41 
 
 
250 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40.5 
 
 
394 aa  153  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  38.63 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  39.2 
 
 
270 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  38.84 
 
 
425 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.2 
 
 
395 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  38.93 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  36.51 
 
 
452 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  35.46 
 
 
241 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  34.69 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  35.8 
 
 
422 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.07 
 
 
381 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  38.27 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  33.75 
 
 
449 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  35.02 
 
 
250 aa  125  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  36.29 
 
 
264 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.1 
 
 
245 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 
404 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.58 
 
 
554 aa  122  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.55 
 
 
519 aa  122  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  35.52 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.75 
 
 
241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  35.11 
 
 
443 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  34.44 
 
 
474 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1685  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
221 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614015  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  34.98 
 
 
421 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.45 
 
 
597 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  36.73 
 
 
564 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  31.68 
 
 
441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 
426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.22 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  35.66 
 
 
256 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  33.33 
 
 
243 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  29.48 
 
 
245 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
463 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  36.71 
 
 
469 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  31.68 
 
 
548 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  29.39 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  35.63 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  33.6 
 
 
276 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
259 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
259 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.58 
 
 
611 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  32.3 
 
 
267 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  31.52 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 
320 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 
540 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  36.33 
 
 
449 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  32.79 
 
 
466 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  34.92 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.71 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.61 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  33.71 
 
 
538 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 
467 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  34.66 
 
 
234 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  31.08 
 
 
241 aa  109  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 
239 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
574 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 
319 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  34.55 
 
 
463 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.29 
 
 
470 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  30.77 
 
 
247 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  32.58 
 
 
505 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
478 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.84 
 
 
247 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  30.77 
 
 
247 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  34.58 
 
 
276 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  34.52 
 
 
262 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.97 
 
 
239 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  33.88 
 
 
507 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 
500 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  33.9 
 
 
248 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  33.47 
 
 
256 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  32.38 
 
 
571 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  32.57 
 
 
270 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  34.93 
 
 
264 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.88 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.52 
 
 
261 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  32.11 
 
 
239 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  35.89 
 
 
242 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 
255 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  33.88 
 
 
265 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
416 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.42 
 
 
417 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  34.01 
 
 
242 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>