More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0386 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  44.14 
 
 
323 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  47.98 
 
 
296 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  43.53 
 
 
325 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.76 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  46.36 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  43.97 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  44.74 
 
 
293 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  41 
 
 
287 aa  168  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  42.35 
 
 
258 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.24 
 
 
452 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  44.49 
 
 
274 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  43.61 
 
 
302 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 
395 aa  158  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 
394 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  40.97 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  43.11 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  41.6 
 
 
270 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  41.25 
 
 
463 aa  148  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  40.71 
 
 
416 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1685  protein serine/threonine phosphatase  42.79 
 
 
221 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
479 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.08 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  43.21 
 
 
276 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  37.61 
 
 
425 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.1 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  35.32 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  37.89 
 
 
564 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.82 
 
 
421 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 
238 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  41.49 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  38.53 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  38.3 
 
 
519 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
404 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  36.99 
 
 
554 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.8 
 
 
422 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  39.48 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.19 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  37.44 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  36.24 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 
540 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
238 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  34.17 
 
 
449 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  38.02 
 
 
507 aa  128  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  37.71 
 
 
462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  33.95 
 
 
435 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  35.68 
 
 
241 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  36.93 
 
 
441 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 
426 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  37.72 
 
 
319 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  39.45 
 
 
364 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  36.96 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  37.33 
 
 
472 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  37.1 
 
 
478 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.24 
 
 
438 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  37.84 
 
 
505 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 
538 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  32.47 
 
 
236 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.53 
 
 
239 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  37.25 
 
 
253 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  36.29 
 
 
571 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
467 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
252 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  37.4 
 
 
245 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  38.12 
 
 
463 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.65 
 
 
482 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.06 
 
 
271 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 
239 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
271 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  36.87 
 
 
478 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  37.93 
 
 
256 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  33.89 
 
 
474 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 
255 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  38.11 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  37.95 
 
 
355 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  36.25 
 
 
466 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  35.98 
 
 
469 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.12 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  37.24 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  34.93 
 
 
244 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  37.92 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  30.42 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 
417 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.69 
 
 
242 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  36.1 
 
 
558 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  38.86 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  34.24 
 
 
419 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.3 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 
320 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  37.85 
 
 
519 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  35.17 
 
 
261 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.51 
 
 
274 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>