36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1474 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  42.48 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  33.48 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  32.88 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  34.07 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  34.07 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  34.07 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  34.07 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  34.07 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  34.07 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.09 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  35.85 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.34 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  36.43 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  27.08 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  31.65 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  36.03 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  32.37 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  37.5 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  35.78 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.5 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  37.63 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  35.23 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  36.24 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  40.7 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  29.55 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  32.32 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  24.09 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  38.64 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  38.04 
 
 		 163 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  29.55 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  36.96 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  32.94 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  27.91 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  28.71 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>