42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0147 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  97.79 
 
 		 226 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  62.09 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  34.67 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  48.18 
 
 		 478 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  30.94 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  37.84 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  28.57 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  36.17 
 
 		 483 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  32.42 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  31.63 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  49.02 
 
 		 208 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  33.57 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  44.57 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  35.09 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  32.37 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.71 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  29.66 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  32.37 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  40.23 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  34.81 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  34.07 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  34.07 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  34.07 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  31.34 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  37.06 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.74 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  35.46 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  35.46 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  34.41 
 
 		 328 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  28.71 
 
 		 330 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  28.43 
 
 		 329 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  28.43 
 
 		 329 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  28.43 
 
 		 329 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  28.43 
 
 		 329 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  28.43 
 
 		 329 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  28.43 
 
 		 329 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  22.76 
 
 		 337 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>