More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2697 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2697  ABC transporter membrane spanning protein (agrocinopine)  100 
 
 
305 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6467  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  49.34 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
308 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.18 
 
 
309 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0396577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
310 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  38.87 
 
 
327 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
306 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
306 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
302 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473932  normal  0.177469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
308 aa  218  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
306 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.32 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
306 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
306 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.32 
 
 
336 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
306 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
311 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.47 
 
 
306 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  38.21 
 
 
337 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
306 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
306 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
326 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508516  normal  0.0813716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  38.82 
 
 
307 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
326 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
306 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
327 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
306 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
326 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
327 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  37.72 
 
 
336 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
336 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.82 
 
 
306 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
327 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.43 
 
 
336 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  37.43 
 
 
336 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  37.43 
 
 
336 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.5 
 
 
306 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
313 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
306 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
324 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  38.49 
 
 
306 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  38.49 
 
 
306 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  38.49 
 
 
306 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
336 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
336 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  36.34 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  38.49 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
304 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  39.47 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  39.47 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
307 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
307 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
306 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
326 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  40.29 
 
 
306 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.29 
 
 
306 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
318 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
335 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
334 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  39.47 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
304 aa  195  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
306 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
328 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
306 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
306 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
306 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
306 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
324 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
305 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
306 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
306 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>