More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1949 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1949  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1042  PfkB  40.8 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  33.8 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  31.71 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  33.12 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  33.44 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  33.12 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  33.12 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  33.12 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34.45 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  31.89 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  31.89 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  32.57 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  32.57 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  32.57 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  32.57 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  32.57 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.31 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  28.2 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.77 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  29.29 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  31.85 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  26.17 
 
 		 401 aa  85.9  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.97 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.76 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  29.43 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.89 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.62 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.17 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.28 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  29.49 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  30.1 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29.41 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  29.49 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  29.49 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  29.49 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  30.1 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  27.95 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  29.79 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  29.49 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  29.49 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  31.07 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.52 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  27.52 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  28.14 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  29.49 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  28.92 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  27.91 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  29.76 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  28.01 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  29.6 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  28.16 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  27.24 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  30.36 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  29.51 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  29.84 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  27.67 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  27.67 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  25.25 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.42 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.67 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  27.74 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.08 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  27.15 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  26.1 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  27.33 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  29.83 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.83 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  24.07 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  26.51 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  27.11 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  25.08 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  29.9 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  29.49 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  28.99 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  32.32 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  23.29 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  24.75 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.41 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.48 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  24.56 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  32.86 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.14 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  27.46 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  23.87 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  24.61 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  26.85 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  31.44 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  26.3 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  30.45 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  24.62 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  26.85 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  25.42 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  27.21 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  25.18 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>