69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6403 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  100 
 
 		 153 aa  309  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  75.17 
 
 		 153 aa  234  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  71.52 
 
 		 159 aa  224  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  70.97 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  71.52 
 
 		 159 aa  224  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  71.52 
 
 		 159 aa  224  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  71.14 
 
 		 169 aa  224  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  80 
 
 		 170 aa  222  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  70.97 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  69.68 
 
 		 157 aa  215  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  68.63 
 
 		 160 aa  213  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  67.53 
 
 		 166 aa  211  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  72.11 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  69.18 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  63.45 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  61.9 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  60 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  62.82 
 
 		 157 aa  174  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  68.66 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  57.53 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  55.48 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  55.48 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  56.85 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  44.13 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  39.53 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  38.3 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  37.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  40 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  37.59 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  39.29 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  37.86 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  35.88 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  34.51 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  35.07 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  34.51 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  35.2 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  30.23 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  34.51 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  30.32 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  30.28 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  36.99 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  28.47 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  38.71 
 
 		 478 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  30.07 
 
 		 358 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  33.1 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  29.77 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  28.78 
 
 		 354 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  29.01 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  29.01 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  26.92 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  29.05 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  31.08 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  28.97 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  30.94 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  28.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  31.43 
 
 		 494 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  34.83 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  32.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  28.68 
 
 		 371 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  28.69 
 
 		 148 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 132 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11163  ER glycosyl hydrolase (Edem), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02290)  30.77 
 
 		 1339 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>