52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2712 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  43.29 
 
 
162 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  40.61 
 
 
163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  42.17 
 
 
177 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  43.79 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  38.89 
 
 
494 aa  111  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  40.12 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  37.16 
 
 
151 aa  90.9  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  55 
 
 
86 aa  84.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.14 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  29.03 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  35.65 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  32.47 
 
 
148 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  27.1 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  27.89 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  29.06 
 
 
155 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  32.89 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  30.56 
 
 
166 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  27.21 
 
 
151 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  26.4 
 
 
125 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  26.2 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  33 
 
 
478 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  30.2 
 
 
143 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  28.75 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  30.2 
 
 
143 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  28.83 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  28.97 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  34.55 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  28.08 
 
 
358 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  32.24 
 
 
140 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  28.21 
 
 
167 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  27.4 
 
 
367 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  27.52 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  27.46 
 
 
353 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  27.46 
 
 
353 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  27.46 
 
 
353 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  28.39 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  34.74 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  27.61 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  30.25 
 
 
156 aa  44.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  28.17 
 
 
354 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  30.68 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  33.75 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  33.33 
 
 
191 aa  41.6  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  28 
 
 
138 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  32.41 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2581  hypothetical protein  38.78 
 
 
50 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  28.18 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  37.18 
 
 
143 aa  40.8  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  28.18 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  28.18 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>