28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2580 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  67.06 
 
 		 163 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  62.35 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  52.38 
 
 		 494 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  55 
 
 		 180 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  48.81 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  41.77 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  34.88 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  31.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  53.19 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  31.65 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  35.44 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  30.95 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  32.93 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  31.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  29.27 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  32.91 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  30.49 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  30.49 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  34.15 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  31.33 
 
 		 354 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  30.77 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  30.95 
 
 		 478 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  27.06 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  31.25 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>