74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0413 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  40.6 
 
 		 133 aa  103  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  40.6 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  39.1 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  42.75 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  39.39 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  39.06 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  37.61 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  35.43 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  35.94 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  34.15 
 
 		 367 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  32.56 
 
 		 167 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  32.52 
 
 		 354 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  29.23 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  33.59 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  30.4 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  29.31 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  30.23 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  28 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  26.05 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  29.06 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  28.99 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  29.06 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  30.23 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  26.72 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  29.91 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  30.71 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  29.51 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  34.45 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  26.67 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  29.69 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  27.69 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  26.4 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  36.26 
 
 		 478 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  27.96 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  27.42 
 
 		 371 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  37.31 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  26.52 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  27.34 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  24.43 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  27.05 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  28 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  25 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  23.66 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  26.23 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  26.32 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  22.9 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  22.9 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  22.9 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  31.78 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  24.81 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  27.07 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  27.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  23.08 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  26.56 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11163  ER glycosyl hydrolase (Edem), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02290)  31 
 
 		 1339 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  32.91 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  28.46 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  28.46 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  28.46 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  28.46 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  28.46 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  25 
 
 		 149 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  25.98 
 
 		 169 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  28.46 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  28.57 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  30.71 
 
 		 268 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  27.91 
 
 		 168 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>