65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3184 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  100 
 
 
143 aa  282  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  95.1 
 
 
143 aa  270  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  94.41 
 
 
143 aa  268  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  75.52 
 
 
143 aa  204  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  68.66 
 
 
140 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  71.21 
 
 
138 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  41.55 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  34.56 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  35.92 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  38.3 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  34.07 
 
 
367 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  34.07 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  34.07 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  34.07 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  33.8 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  33.33 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  35.62 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  36.17 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  33.8 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  34.04 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  34.07 
 
 
354 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  36.94 
 
 
191 aa  70.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  35.46 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  29.45 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  37.66 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  34.25 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  34.25 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  34.25 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  33.33 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  33.77 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  40.48 
 
 
478 aa  67  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  36.88 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  30.99 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  26.39 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  32.88 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  34.25 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  32.62 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  35.21 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  33.8 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  36.43 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  34.75 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  38.82 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  29.17 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  29.27 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  30.22 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  26.72 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  30.5 
 
 
371 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  39.47 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  30.77 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  28.47 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  30.2 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  27.66 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  32.89 
 
 
152 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  37.97 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  30.5 
 
 
494 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11163  ER glycosyl hydrolase (Edem), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02290)  30.69 
 
 
1339 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962719  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  36.9 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  31.43 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  36.71 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  28.67 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  30.07 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  28.87 
 
 
197 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  26.45 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>