61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2442 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  59.88 
 
 		 162 aa  200  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  48.17 
 
 		 494 aa  160  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  67.06 
 
 		 86 aa  123  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  42.59 
 
 		 177 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  40.61 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  42.18 
 
 		 149 aa  97.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  34.36 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2581  hypothetical protein  71.43 
 
 		 50 aa  84.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  33.56 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  31.65 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  34.41 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  29.2 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  31.76 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  25.33 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  26.17 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  33.12 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  27.94 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  24.68 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  24.68 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  30.88 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  24.68 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  27.94 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  29.41 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  28 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  33.12 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  33.12 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  33.12 
 
 		 188 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  26.9 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  28.47 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  33.12 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  33.12 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  29.58 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  29.63 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  31.07 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  30.34 
 
 		 478 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  28.08 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  31.9 
 
 		 324 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  34.58 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  26.9 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  22.82 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  23.23 
 
 		 367 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  24.32 
 
 		 358 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  26.28 
 
 		 354 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  28.16 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  26.43 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  33.94 
 
 		 371 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  26 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  24.65 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  26.49 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  28.69 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  31.48 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  30.28 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  23.91 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  27.27 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  40.8  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>