72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1390 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  49.17 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  47.7 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  44.51 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  34 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  34.44 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  30.82 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  29.45 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  33.11 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  31.72 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  28.67 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  33.11 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  30.26 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  30.07 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  30.72 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  32.21 
 
 		 494 aa  58.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  31.58 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  38.55 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  30.97 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  30.32 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  38.75 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  30.26 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  30.26 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  30.26 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  30.92 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  29.81 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  31.17 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  30.46 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  29.8 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  31.61 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  32.45 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  25.33 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  28.19 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  28.15 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  28.95 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  28.75 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  27.94 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  29.87 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  28.67 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  31.45 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  28.67 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  28.67 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  27.85 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  32.08 
 
 		 324 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  26.83 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  31.25 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  26.98 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  26.83 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  30.63 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  28.66 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  30.63 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  35.71 
 
 		 157 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  37.68 
 
 		 371 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  26.56 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2566  hypothetical protein  25.5 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0683138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  31.25 
 
 		 358 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  29.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  29.87 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  25.76 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  28.66 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  25.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  27.45 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11163  ER glycosyl hydrolase (Edem), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02290)  29.63 
 
 		 1339 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4694  AIG2 family protein  28.74 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  28.38 
 
 		 354 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  32.47 
 
 		 149 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  30.38 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>