40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0424 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  49.25 
 
 		 494 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  43.79 
 
 		 180 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  43.06 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  42.18 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  39.58 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  31.97 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  31.76 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  36.11 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  36.3 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  33.1 
 
 		 353 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  33.1 
 
 		 353 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  33.1 
 
 		 353 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  35.82 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  27.39 
 
 		 183 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  34.88 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  34.33 
 
 		 367 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  30.71 
 
 		 324 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  25 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  25.64 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  32.2 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  28.66 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  26.9 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  29.29 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  29.29 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  29.14 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  28.39 
 
 		 156 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  29.77 
 
 		 371 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  29.14 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  29.14 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  29.14 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  30.77 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  29.14 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  26.67 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>