65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1726 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  50 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  51.02 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  47.02 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  41.61 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  38.85 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  39.39 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  36.43 
 
 		 358 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  33.57 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  33.58 
 
 		 354 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  35.56 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  34.09 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  35.07 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  36.22 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  33.86 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  34.92 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  29.58 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  32.37 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  29.27 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  29.27 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  28.15 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  34.88 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  30.07 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  30.22 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  30.15 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  27.41 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  30.83 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  30.14 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  33.85 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  29.27 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  33.07 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  26.67 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  38.1 
 
 		 478 aa  58.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  29.29 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  29.93 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  29.93 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  29.93 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  30.28 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  30.94 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  31.54 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  28.77 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  29.92 
 
 		 371 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  31.11 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  29.37 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  29.85 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  31.33 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  35.63 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  36.49 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  28.16 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  27.89 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  26.9 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  27.78 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  30.38 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4694  AIG2 family protein  26.09 
 
 		 237 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>