61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0688 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  100 
 
 
169 aa  342  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  78 
 
 
153 aa  248  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  77.48 
 
 
156 aa  226  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  71.14 
 
 
153 aa  224  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  66.23 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  66.23 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  74.5 
 
 
170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  66.23 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  66.23 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  65.58 
 
 
157 aa  208  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  66.45 
 
 
160 aa  206  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  64.94 
 
 
157 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  64.63 
 
 
150 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  66.01 
 
 
166 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  65.73 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  64.08 
 
 
146 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  64.34 
 
 
151 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  66.67 
 
 
149 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  62.24 
 
 
151 aa  181  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  58.5 
 
 
149 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  67.16 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  62.99 
 
 
157 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  56.85 
 
 
149 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  47.46 
 
 
184 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  34.29 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  34.29 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  34.62 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  32.62 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  31.91 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  32.62 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  33.08 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  34.09 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  32.39 
 
 
143 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  30.99 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  29.86 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  31.11 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  29.37 
 
 
197 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  30.16 
 
 
133 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  30.16 
 
 
133 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  30.16 
 
 
133 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  30.28 
 
 
151 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  31.2 
 
 
371 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  32.64 
 
 
187 aa  48.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  27.08 
 
 
196 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  31.75 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  31.65 
 
 
358 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  30.94 
 
 
367 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  30.99 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  29.79 
 
 
354 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  34.07 
 
 
478 aa  44.3  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  27.21 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  28.48 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  29.33 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  25.98 
 
 
125 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  29.9 
 
 
191 aa  41.2  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  31.82 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  32.08 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>