41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4442 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  411  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2566  hypothetical protein  64.33 
 
 
191 aa  238  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0683138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  63.86 
 
 
195 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  35.8 
 
 
371 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  35.61 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  33.55 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  31.65 
 
 
494 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  28.67 
 
 
151 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  27.46 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  28.57 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  30.82 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  29.11 
 
 
157 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  29.37 
 
 
169 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  30.99 
 
 
184 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  27.86 
 
 
159 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  29.29 
 
 
153 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  28.39 
 
 
138 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  26.39 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  30.14 
 
 
140 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  28.19 
 
 
160 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  28.77 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  28 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  28.38 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  29.86 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  29.11 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  28.39 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  27.85 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  26.58 
 
 
159 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  26.58 
 
 
159 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  26.58 
 
 
159 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  30 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  26.32 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  29.22 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  35.14 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  28.78 
 
 
324 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4028  hypothetical protein  24.49 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0119928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  27.78 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  27.59 
 
 
143 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  28.87 
 
 
143 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  27.13 
 
 
149 aa  41.6  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  26.71 
 
 
143 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>