65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5929 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  85.62 
 
 
146 aa  258  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  64.08 
 
 
169 aa  193  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  61.27 
 
 
153 aa  189  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  66.9 
 
 
156 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  60 
 
 
153 aa  184  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  60.69 
 
 
150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  60 
 
 
151 aa  179  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  64.58 
 
 
149 aa  178  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  55.7 
 
 
159 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  55.7 
 
 
159 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  55.7 
 
 
159 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  57.93 
 
 
151 aa  173  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  55.7 
 
 
159 aa  173  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  63.38 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  58.9 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  55.7 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  55.48 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  54.36 
 
 
157 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  55.1 
 
 
166 aa  161  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  58.67 
 
 
157 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  61.54 
 
 
135 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  57.14 
 
 
149 aa  146  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  43.5 
 
 
184 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  37.32 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  36.62 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  35.92 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  36.43 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  36.43 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  34.27 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  36.43 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  31.94 
 
 
196 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  33.8 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  33.8 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  37.88 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  32.86 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  32.64 
 
 
167 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  30.28 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  30.23 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  32.14 
 
 
367 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  30.94 
 
 
162 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  28.57 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  31.25 
 
 
371 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  32.54 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  30.94 
 
 
354 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  31.2 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  31.2 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  30.94 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  30.77 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  28.77 
 
 
197 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  31.2 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  31.15 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  29.17 
 
 
494 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  26.45 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  29.17 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  36.84 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  34.01 
 
 
157 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  31.52 
 
 
478 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  29.37 
 
 
168 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>