45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3519 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  67.16 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  68.66 
 
 		 153 aa  190  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  65.67 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  60.43 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  60.43 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  60.43 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  65.91 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  70.15 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  60.43 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  68.66 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  64.62 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  58.99 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  58.39 
 
 		 160 aa  166  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  58.99 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  61.54 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  59.54 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  55.8 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  63.36 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  61.97 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  56.49 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  55.73 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  55.73 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  45.12 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  33.9 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  34.23 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  30.95 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  30.16 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  30.95 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  30.53 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  32.8 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  31.2 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  32.76 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  30 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  30.4 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  33.04 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  29.23 
 
 		 151 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  28.32 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  27.73 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  28.32 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  27.43 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>