61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4371 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  100 
 
 
157 aa  315  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  62.82 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  62.99 
 
 
169 aa  191  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  62.34 
 
 
153 aa  190  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  57.76 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  57.76 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  57.76 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  57.76 
 
 
159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  60 
 
 
150 aa  179  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  57.69 
 
 
160 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  55.9 
 
 
157 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  57.32 
 
 
166 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  175  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  58.67 
 
 
146 aa  173  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  63.64 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  64.1 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  61.44 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  53.42 
 
 
157 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  57.62 
 
 
151 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  56.29 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  52.94 
 
 
149 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  61.97 
 
 
135 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  54.9 
 
 
149 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  44.97 
 
 
184 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  36.36 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  37.66 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  37.66 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  40.14 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  39.86 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  40.71 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  38.93 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  38.1 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  32.39 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  31.13 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  34.31 
 
 
167 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  29.03 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  32.65 
 
 
353 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  32.65 
 
 
353 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  32.65 
 
 
353 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  36.19 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  33.33 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  35.35 
 
 
478 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  27.61 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  30.77 
 
 
367 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  30.2 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  30.56 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  27.85 
 
 
183 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  31.51 
 
 
494 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  28.06 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  28.06 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  27.27 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  28.06 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  30.82 
 
 
354 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  32.89 
 
 
187 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  28.48 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  31.85 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  29.66 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  30.77 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  32.82 
 
 
148 aa  40.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>