62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1791 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  79.62 
 
 
166 aa  254  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  76.1 
 
 
159 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  76.1 
 
 
159 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  76.1 
 
 
159 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  76.1 
 
 
159 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  76.1 
 
 
157 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  74.84 
 
 
157 aa  236  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  68.63 
 
 
153 aa  213  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  65.79 
 
 
153 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  66.45 
 
 
169 aa  206  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  71.24 
 
 
170 aa  203  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  66.01 
 
 
156 aa  192  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  65.1 
 
 
149 aa  177  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  56.85 
 
 
146 aa  174  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  55.48 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  58 
 
 
150 aa  167  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  55.1 
 
 
149 aa  160  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  57.69 
 
 
157 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  55.78 
 
 
151 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  58.39 
 
 
135 aa  150  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  54.42 
 
 
151 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  51.7 
 
 
149 aa  133  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  46.7 
 
 
184 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  39.2 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  39.16 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  34 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  32.67 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  37.76 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  33.33 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  32.39 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  34.31 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  35.78 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  32.87 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  28.77 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  28.29 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  35.66 
 
 
353 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  35.66 
 
 
353 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  35.66 
 
 
353 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  32.28 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  31.03 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  32.45 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  31.03 
 
 
151 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  35.79 
 
 
478 aa  52  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  32.64 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  33.1 
 
 
187 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  28.19 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  26.79 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  29.37 
 
 
196 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  25 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  28.68 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  28.68 
 
 
133 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  27.45 
 
 
371 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  27.21 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  28.68 
 
 
133 aa  43.9  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  30.28 
 
 
367 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  28.86 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  29.37 
 
 
358 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  30.28 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  29.58 
 
 
354 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  32.41 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  33.55 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>