58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0695 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  85.62 
 
 		 146 aa  258  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  65.73 
 
 		 169 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  60.69 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  63.45 
 
 		 153 aa  191  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  66.21 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  58.67 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  58.67 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  58.67 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  66.43 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  57.72 
 
 		 159 aa  179  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  60.69 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  59.59 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  63.45 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  61.64 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  57.05 
 
 		 157 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  56.85 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  57.53 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  54.36 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  54.36 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  60 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  64.62 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  56.46 
 
 		 149 aa  146  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  42.94 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  34.04 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  34.75 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  34.04 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.21 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  38.71 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  35 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  34.29 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  31.08 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  34.51 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  32.45 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  30.07 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  34.85 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  33.85 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  30.92 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  35.34 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  31.43 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  27.69 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  32.54 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  32.54 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  32.54 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  27.21 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  30.22 
 
 		 367 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  28.12 
 
 		 371 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  29.41 
 
 		 354 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  29.35 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  29.08 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  29.29 
 
 		 358 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  26.45 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  27.27 
 
 		 494 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>