37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1057 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  321  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  40.27 
 
 		 188 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  40.27 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  40.27 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  39.6 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  39.6 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  39.6 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  37.25 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  33.77 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  32.47 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  29.8 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  29.05 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  29.81 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  28.1 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  29.68 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  31.51 
 
 		 494 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  28.03 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  28.4 
 
 		 354 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  32.76 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  25.5 
 
 		 367 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  29.03 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4694  AIG2 family protein  27.92 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  30.22 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  26.71 
 
 		 358 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  26.45 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  30.25 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  24.03 
 
 		 353 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  24.03 
 
 		 353 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  24.03 
 
 		 353 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  26.32 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  29.75 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  29.22 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  24.36 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  28.39 
 
 		 149 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  26.32 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  26.45 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  26.45 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>