86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4235 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  100 
 
 
152 aa  315  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  92.72 
 
 
151 aa  285  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  35.57 
 
 
184 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  38.3 
 
 
494 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  35.81 
 
 
187 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  36.62 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  35.14 
 
 
180 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  38.1 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  37.93 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  34.93 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  32.43 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  37.14 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  34 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  37.06 
 
 
367 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  36.69 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  31.69 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  31.76 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  33.79 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  36.69 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  36.69 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  36.96 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  35.97 
 
 
354 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  35.21 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  33.1 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  39.06 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  36.84 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  28.08 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  36.18 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  36.18 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  34.01 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  33.8 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  34.51 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  32.47 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  30.99 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  33.59 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  30.99 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  30.28 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  34.93 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  33.33 
 
 
371 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  32.21 
 
 
324 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  32.17 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  31.94 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  35.2 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  35.2 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4028  hypothetical protein  31.41 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0119928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  30.34 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  35.2 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  34.85 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  32.19 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  32.19 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  33.8 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  32.19 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  32.19 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  28.97 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  30.83 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  33.33 
 
 
478 aa  58.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  30.34 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  28.87 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  29.86 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  30.28 
 
 
195 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  31.13 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  33.33 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  30.99 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4170  hypothetical protein  30.97 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00792981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  27.46 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  31.03 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  35.11 
 
 
191 aa  52.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  32 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  32.79 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  30.56 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4144  hypothetical protein  29.68 
 
 
175 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  33.08 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  35.8 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2566  hypothetical protein  24.67 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0683138  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  30.95 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4694  AIG2 family protein  26.67 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  28.24 
 
 
276 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  32.03 
 
 
268 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  29.35 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  27.34 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>