58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2771 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  100 
 
 
494 aa  1021    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  48.17 
 
 
163 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  48.17 
 
 
162 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  45.06 
 
 
177 aa  126  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  49.25 
 
 
149 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2234  hypothetical protein  36.18 
 
 
214 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  38.89 
 
 
180 aa  111  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  52.38 
 
 
86 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  39.38 
 
 
168 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  37.86 
 
 
151 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  38.3 
 
 
152 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  41.73 
 
 
148 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  33.12 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  33.76 
 
 
187 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  36.62 
 
 
195 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  30.77 
 
 
183 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2566  hypothetical protein  32.1 
 
 
191 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0683138  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  32.21 
 
 
185 aa  58.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  31.88 
 
 
138 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  31.08 
 
 
140 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  31.65 
 
 
197 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  34.62 
 
 
152 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  34.64 
 
 
175 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  35.06 
 
 
188 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  30.5 
 
 
184 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  33.09 
 
 
367 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  30.99 
 
 
354 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  35.64 
 
 
191 aa  53.9  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  33.55 
 
 
157 aa  53.9  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  32.37 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  32.37 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  32.37 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  33.68 
 
 
478 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  29.79 
 
 
151 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  31.91 
 
 
143 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  31.51 
 
 
156 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  33.96 
 
 
155 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  29.08 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  31.21 
 
 
143 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  28.78 
 
 
151 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  27.63 
 
 
185 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  31.25 
 
 
371 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2581  hypothetical protein  45.1 
 
 
50 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  32.04 
 
 
133 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  31.43 
 
 
153 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  29.17 
 
 
146 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  35.37 
 
 
149 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  30.99 
 
 
153 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  30.5 
 
 
143 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  29.79 
 
 
143 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  29.86 
 
 
324 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  30.1 
 
 
133 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>