57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1254 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  278  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  93.23 
 
 
133 aa  265  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  90.98 
 
 
133 aa  262  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  39.1 
 
 
125 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  35.82 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  34.85 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  34.68 
 
 
371 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  30.88 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  33.6 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.2 
 
 
152 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  33.07 
 
 
354 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  28.15 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  29.32 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  32.28 
 
 
353 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  32.28 
 
 
353 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  31.3 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  32.28 
 
 
353 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  34.88 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  34.15 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  29.13 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  31.54 
 
 
367 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  32.79 
 
 
358 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  26.57 
 
 
324 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  30.89 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  32.52 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  29.77 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  32.54 
 
 
146 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  30.16 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  28.03 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  30.65 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  29.71 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  28.57 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  31.2 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  31.63 
 
 
151 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  32.04 
 
 
494 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  29.32 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  26.98 
 
 
185 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  33.77 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  28.68 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  30.3 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  30.69 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  32.47 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  26.4 
 
 
177 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  28.69 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  26.28 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  28.7 
 
 
157 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  32.43 
 
 
185 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  26.61 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  27.14 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  32.58 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  32.91 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4209  AIG2 family protein  27.78 
 
 
195 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  27.64 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  27.64 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  27.64 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>