31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2389 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  319  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  38.41 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  36 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  34.9 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  30.14 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  31.29 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  34.72 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  29.92 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  31.25 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  32.81 
 
 
353 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  32.81 
 
 
353 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  32.81 
 
 
353 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  31.25 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  26.87 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  27.94 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  29.63 
 
 
367 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  29.73 
 
 
358 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  40.51 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  25.33 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  24.65 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  36.9 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  33.68 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  30.56 
 
 
354 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  36.84 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  32.98 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  36.84 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  35.53 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  30.65 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  32.63 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>