41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4490 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  100 
 
 
148 aa  298  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  37.41 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  41.73 
 
 
494 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  37.14 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  34.78 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  37.06 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  31.65 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  32.47 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  31.88 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  26.87 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  34.72 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  34.72 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1208  hypothetical protein  34.72 
 
 
188 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  34.72 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  34.72 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  53.19 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  32.52 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  29.41 
 
 
358 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  30.3 
 
 
353 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  36.25 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  31.15 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  30.3 
 
 
353 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  30.3 
 
 
353 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  30.37 
 
 
367 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  32.26 
 
 
354 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  30.83 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  31.31 
 
 
478 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  34.01 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  31.93 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  35.06 
 
 
191 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  28.69 
 
 
153 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  31.18 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  31.93 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0807  hypothetical protein  34.68 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.749649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  30.82 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  25.64 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  30.14 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38526  predicted protein  30.63 
 
 
323 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  29.25 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  32.22 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>