56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13590 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  100 
 
 
191 aa  398  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  42.15 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  44.79 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  37.89 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  37.89 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  36.94 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  35.77 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  37.63 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  30.6 
 
 
478 aa  62  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  39.77 
 
 
353 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  39.77 
 
 
353 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  39.77 
 
 
353 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  37.62 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  37.5 
 
 
367 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  31.75 
 
 
167 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  34.88 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  30.19 
 
 
358 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  39.02 
 
 
354 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  26.05 
 
 
125 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  34.57 
 
 
132 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  29.19 
 
 
151 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  37.5 
 
 
177 aa  54.7  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  35.64 
 
 
494 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  38.14 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  34.41 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  37.08 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  36.19 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  35.05 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.11 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  38 
 
 
150 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  32.63 
 
 
371 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  36.05 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  34.78 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  34.67 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  34.02 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  30.77 
 
 
146 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  35.96 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  35.96 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  35.96 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  34.65 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  34.83 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  33.77 
 
 
133 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  35.96 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  32.99 
 
 
156 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  32.47 
 
 
133 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  29.35 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  31.33 
 
 
86 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  32.47 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  33.68 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  24.43 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  35.06 
 
 
148 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  29.9 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>