38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1870 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  100 
 
 		 132 aa  275  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  46.15 
 
 		 478 aa  72  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  44.59 
 
 		 354 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  34.43 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  38.82 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  37.65 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  37.65 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  42.31 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  34.57 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  37.5 
 
 		 358 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  41.03 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  41.03 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  37.21 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  38.46 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  36.25 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2554  hypothetical protein  51.16 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  37.31 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  34.88 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.8 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  35.9 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  36.49 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11163  ER glycosyl hydrolase (Edem), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02290)  34.34 
 
 		 1339 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  37.04 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  34.52 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  34.12 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  34.12 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  34.12 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  29.27 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  34.52 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  33.75 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 153 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>