62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2748 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  100 
 
 
143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  75.52 
 
 
143 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  74.83 
 
 
143 aa  200  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  73.43 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  66.19 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  66.19 
 
 
138 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  38.81 
 
 
354 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  35.56 
 
 
358 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  32.62 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  36.57 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  36.57 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  36.57 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  39.29 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  37.86 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  31.69 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  34.33 
 
 
367 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  36.43 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  40 
 
 
478 aa  67  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  31.72 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  35.77 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  32.86 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  34.69 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  34.69 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  38.1 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  36.07 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  35.92 
 
 
170 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  32.87 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  31.91 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  29.31 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  29.37 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  32.62 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  32.39 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  28.89 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  29.29 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  32.65 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  32.65 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  32.65 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  42.31 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  32.88 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  29.08 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  35.51 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  29.2 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  30.15 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  32.86 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11163  ER glycosyl hydrolase (Edem), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02290)  36.27 
 
 
1339 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962719  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  35.56 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  30.16 
 
 
167 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  31.91 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  31.47 
 
 
187 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  34.62 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  32.04 
 
 
371 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  31.91 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  33.33 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  29.79 
 
 
494 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  28.77 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  34.62 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  34.15 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  26.71 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  37.18 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>