55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2560 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  306  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  58.5 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  58.5 
 
 		 153 aa  178  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  61.64 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  58.9 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  59.59 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  54.67 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  57.53 
 
 		 153 aa  167  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  55.33 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  55.33 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  62.07 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  55.33 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  59.86 
 
 		 170 aa  163  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  54.67 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  55.1 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  52.67 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  60.14 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  53.06 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  53.74 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  53.06 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  59.54 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  55.7 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  46.41 
 
 		 184 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  52.94 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  31.91 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  33.8 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  33.85 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  32.87 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  32.17 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  28.97 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  28.17 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  35.11 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  29.37 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  30.77 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  31.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  31.72 
 
 		 358 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  30.97 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  29.53 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  26.24 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  31.25 
 
 		 367 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  31.72 
 
 		 353 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  31.72 
 
 		 353 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  31.72 
 
 		 353 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  25 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  29.77 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  30.16 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  30.3 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  23.08 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  27.45 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  30.56 
 
 		 354 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  31.2 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  23.94 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>