31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3951 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3951  AIG2 family protein  100 
 
 
184 aa  369  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  48.6 
 
 
153 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  46.41 
 
 
149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  47.46 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  44.13 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  45.51 
 
 
151 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  48.6 
 
 
156 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  45.2 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  46.7 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  43.82 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  45.81 
 
 
150 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  43.5 
 
 
146 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  45.76 
 
 
157 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  43.82 
 
 
159 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  47.46 
 
 
170 aa  121  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  43.5 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  43.5 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  42.86 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  43.5 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  42.94 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  41.99 
 
 
149 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  44.97 
 
 
157 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  45.12 
 
 
135 aa  98.6  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  45.3 
 
 
149 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  40.51 
 
 
155 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  34.18 
 
 
153 aa  48.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  35.9 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  33.33 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  29.35 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  33.78 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>