55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1231 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  278  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  96.99 
 
 		 133 aa  274  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  90.98 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  40.6 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  34.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  34.09 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  33.06 
 
 		 371 aa  68.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  34.65 
 
 		 354 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  30.15 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  33.86 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  33.86 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  33.86 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  35.2 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  29.32 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  27.41 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  33.7 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  32.31 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  34.4 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  29.92 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  30.71 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  32.79 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  32.93 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  30.89 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  31.71 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  30.15 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  32.54 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  28.03 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  30.16 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  29.01 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  24.48 
 
 		 324 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  30.65 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  28.57 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  31.2 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  29.37 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  29.32 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  27.01 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  30.16 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  26.83 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  27.69 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  28.68 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  30.77 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  32.47 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  26.32 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  26.32 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  26.32 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  30.1 
 
 		 494 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  26.19 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  28.03 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  25.4 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  25.6 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  26.87 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  28.1 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>