62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  100 
 
 
183 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  47.7 
 
 
185 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  39.67 
 
 
185 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  39.31 
 
 
196 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  33.78 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  34.27 
 
 
146 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  28.08 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  31.33 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  27.08 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1254  hypothetical protein  30.88 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  27.08 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  26.39 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1452  hypothetical protein  30.15 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1231  hypothetical protein  30.15 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0164276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  32.45 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  29.25 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  31.47 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  31.13 
 
 
149 aa  61.6  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  29.03 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  28.97 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  30.46 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  30.77 
 
 
494 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  31.03 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  28.47 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  29.37 
 
 
143 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  26.97 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  28.97 
 
 
157 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  28.99 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  27.59 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  28.48 
 
 
151 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  29.17 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  28.29 
 
 
160 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  31.82 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  29.86 
 
 
169 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  32.14 
 
 
152 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  28.47 
 
 
153 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  26.38 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  27.4 
 
 
353 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  27.4 
 
 
353 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  27.4 
 
 
353 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  32.67 
 
 
371 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  35.8 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  27.39 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  26.17 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  27.92 
 
 
358 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  28.03 
 
 
367 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  24.52 
 
 
354 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  28.38 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  29.41 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  29.82 
 
 
324 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  34.94 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  26.9 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4028  hypothetical protein  25.45 
 
 
175 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0119928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  30.53 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  29.14 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  25 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.564633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4170  hypothetical protein  25.15 
 
 
175 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00792981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>