30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0115 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  44.38 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  40.12 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  39.38 
 
 		 494 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  34.36 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  36.65 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  34.48 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  34.93 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  41.77 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  32.68 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  31.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  29.05 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  29.53 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  34 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  29.86 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  26.79 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4490  AIG2 family protein  36.25 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  35.29 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  26.21 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  27.67 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  29.25 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  29.25 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  29.25 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  34.62 
 
 		 157 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  34.57 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  27.21 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  34.18 
 
 		 152 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  35.44 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>