71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2997 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2997  AIG2 family protein  100 
 
 		 143 aa  283  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3222  AIG2 family protein  97.9 
 
 		 143 aa  279  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.310927  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3184  AIG2 family protein  94.41 
 
 		 143 aa  268  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2748  AIG2 family protein  73.43 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.222089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1879  AIG2 family protein  68.66 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0384  AIG2 family protein  71.97 
 
 		 138 aa  185  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.59285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4925  hypothetical protein  34.56 
 
 		 358 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1359  AIG2 family protein  40.14 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.158824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5929  AIG2 family protein  36.62 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0854183  normal  0.0117669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4748  hypothetical protein  36.3 
 
 		 353 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4454  hypothetical protein  36.3 
 
 		 353 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  0.0629243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4367  hypothetical protein  36.3 
 
 		 353 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1820  hypothetical protein  34.81 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6403  AIG2 family protein  37.59 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13590  AIG2-like family protein  37.89 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1284  AIG2 family protein  36.17 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0695  hypothetical protein  34.04 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174418  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0988  AIG2 family protein  33.77 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0781  AIG2 family protein  33.1 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10941  hypothetical protein  34.81 
 
 		 354 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3818  AIG2 family protein  32.62 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13333  hypothetical protein  34.25 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0836  hypothetical protein  33.1 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1791  AIG2 family protein  32.67 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4371  AIG2 family protein  36.36 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3919  hypothetical protein  34.75 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101501  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48950  Fe-only nitrogenase accessory protein AnfR  27.08 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281704  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10218  hypothetical protein  39.29 
 
 		 478 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1275  hypothetical protein  32.88 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.492102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1265  hypothetical protein  32.88 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1248  hypothetical protein  32.88 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05740  AIG2-like family protein  35.46 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4235  AIG2 family protein  30.28 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0688  AIG2 family protein  31.91 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4823  hypothetical protein  31.51 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0778  AIG2 family protein  35.21 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4181  AIG2 family protein  36.43 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.381247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1726  hypothetical protein  29.27 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.118635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2560  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2848  AIG2 family protein  33.9 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1618  hypothetical protein  30.82 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1870  AIG2 family protein  37.65 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1249  hypothetical protein  30.16 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0413  hypothetical protein  29.06 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4679  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  29.79 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1618  hypothetical protein  31.65 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1634  hypothetical protein  33.02 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00186132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4052  AIG2 family protein  27.97 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2442  hypothetical protein  27.94 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1505  AIG2 family protein  31.09 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2389  hypothetical protein  31.25 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1259  hypothetical protein  28.37 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.345549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3911  AIG2 family protein  32.04 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.195524  normal  0.21706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2771  AIG2 family protein  31.21 
 
 		 494 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3277  AIG2 family protein  30.07 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0154915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2712  hypothetical protein  27.52 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.572174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2465  AIG2 family protein  28.06 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.564633 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11163  ER glycosyl hydrolase (Edem), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02290)  30.69 
 
 		 1339 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3519  hypothetical protein  30.48 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0156983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1201  AIG2 family protein  35.44 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000220206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0615  AIG2 family protein  31.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000404906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1057  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2580  hypothetical protein  30.49 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0685  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2410  hypothetical protein  29.33 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1133  hypothetical protein  28.95 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0781  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1745  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.958626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4442  hypothetical protein  27.46 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0834958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>