83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2119 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2119  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 386 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6165  hypothetical protein  33.89 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  hitchhiker  0.00553509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  32.49 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  20.91 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.88 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.18 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.05 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  20.64 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0097  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  28.95 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4337  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848545  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  28.95 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  28.65 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  23.45 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  27.37 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  32.6 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  23.18 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.18 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  26.1 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.18 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.96 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.72 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.84 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1033  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  33.13 
 
 		 529 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.84 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.97 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.84 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.84 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.19 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.97 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.88 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.7 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.77 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.88 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.11 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.11 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  29.39 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  25 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  26.96 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.7 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  24.64 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>