25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6165 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6165  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  757    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  hitchhiker  0.00553509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2119  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6615  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3065  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0097  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 529 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 499 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4337  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848545  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.62 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.25 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.62 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.03 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.38 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0385  hypothetical protein  27.34 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  34.55 
 
 		 445 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>