More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1188 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1188  Exodeoxyribonuclease VII  100 
 
 		 529 aa  1008    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0154172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  26.64 
 
 		 526 aa  127  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  25.2 
 
 		 526 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  27.6 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.78 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1052  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.39 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2727  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  28.9 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0564335  normal  0.143765 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.01 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.12 
 
 		 501 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1945  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.01 
 
 		 502 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0340  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.35 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.2 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.52 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.79 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.12 
 
 		 392 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.42 
 
 		 519 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.22 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1226  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.43 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.901078  normal  0.0774047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.03 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.21 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.85 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.57 
 
 		 446 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.97 
 
 		 443 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.11 
 
 		 393 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.52 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.57 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.57 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.21 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.87 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.03 
 
 		 566 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.68 
 
 		 492 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.04 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.22 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.12 
 
 		 549 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.11 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.82 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.82 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.1 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl331  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.78 
 
 		 404 aa  107  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612527  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2864  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.49 
 
 		 486 aa  107  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265405  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.8 
 
 		 445 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.1 
 
 		 443 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.18 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1280  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.62 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.320775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.61 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.95 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.22 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1153  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.93 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1221  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.93 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.35 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.85 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.85 
 
 		 526 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.77 
 
 		 464 aa  104  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.23 
 
 		 466 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.95 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.44 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.28 
 
 		 514 aa  103  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0428  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.2 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.586212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.96 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0398  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.72 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.08 
 
 		 456 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0421457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.56 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.59 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.05 
 
 		 476 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.38 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.5 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1331  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.82 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.701446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.42 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.23 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.59 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.42 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.06 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.42 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1093  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.11 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.6 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.57 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0057  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  20.61 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.13 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.64 
 
 		 541 aa  101  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0321  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.21 
 
 		 407 aa  101  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.568977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.74 
 
 		 448 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.74 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.13 
 
 		 537 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.67 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.66 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.52 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.82 
 
 		 463 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  29.67 
 
 		 450 aa  100  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12180  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.39 
 
 		 519 aa  100  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.4 
 
 		 436 aa  100  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.74 
 
 		 448 aa  100  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1132  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.52 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692394  normal  0.0141184 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.45 
 
 		 408 aa  99.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.01 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 		 443 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.1 
 
 		 475 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.98 
 
 		 456 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.42 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>